食品车间净化工程的环境监测系统需要保障数据的准确性，以下是一些保障准确性的方法：

选择合适的监测设备：选择符合国家标准要求的监测设备，并根据车间实际情况进行合理布局和调整。

定期维护和校准设备：定期维护和校准设备，确保其工作状态稳定和准确。

建立标准操作程序：建立标准操作程序，规范检测人员的操作步骤和操作方法，以确保准确性和一致性。

严格控制环境干扰：在监测过程中，严格控制环境因素的干扰，例如温度、湿度、气流等。

定期核查数据：定期核查监测数据，及时发现问题并进行处理。

建立质量管理体系：建立完善的质量管理体系，包括监测数据的追溯和记录等，以确保数据的可靠性和准确性。