评估食品厂净化工程的洁净度等级需要进行空气微生物、空气颗粒物、表面微生物以及个人生物污染等方面的检测。以下是具体的评估方法：

空气微生物检测：通过在厂区内设置的采样点，采集空气样品进行细菌、真菌、病毒等检测。参考标准可以是GB/T 18883-2002《室内空气微生物检测方法》。

空气颗粒物检测：通过在厂区内设置的采样点，采集空气样品进行PM2.5、PM10等颗粒物检测。参考标准可以是GB/T 18883-2002《室内空气微生物检测方法》。

表面微生物检测：通过在厂房内设置的采样点，采集各种物品表面样品进行微生物检测。参考标准可以是GB/T 4789.15-2010《食品微生物学检验方法 普通细菌计数法》。

个人生物污染检测：通过在厂房内设置的采样点，采集个人所穿戴的防护设备、工作服等样品进行检测。参考标准可以是GB/T 18883-2002《室内空气微生物检测方法》。

根据检测结果，参考相关标准和规定，对食品厂净化工程的洁净度等级进行评估和判定。

综上所述，评估食品厂净化工程的洁净度等级需要进行空气微生物、空气颗粒物、表面微生物以及个人生物污染等方面的检测。检测结果可以参考相关标准和规定，对食品厂净化工程的洁净度等级进行评估和判定。