医疗净化工程的设计与施工是为了保证医疗机构的环境卫生干净、无菌，从而确保患者的安全。在设计和施工过程中，需要采取一系列措施来避免交叉感染，包括以下几点：

合理设计空气净化系统。医疗机构的空气净化系统应当按照相应标准进行设计，系统应当能够满足不同区域的空气洁净度要求。空气净化系统应当避免产生死角和交叉影响，以减少交叉感染的发生。

严格控制施工场所。医疗净化工程的施工场所应当严格控制，避免影响周围环境和其他施工区域。施工人员应当穿戴相应的防护装备，避免带入异物和细菌等病原体。

采用无菌材料和设备。医疗净化工程的施工过程中需要使用无菌材料和设备，包括无菌手套、无菌口罩、无菌手术衣等，以避免细菌和病毒的污染和传播。

实行分段施工。医疗净化工程的施工过程中应当实行分段施工，避免不同区域的工作人员交叉作业和污染传播。

定期对施工现场进行清洁和消毒。医疗净化工程的施工现场应当定期进行清洁和消毒，以保持环境的清洁和卫生。

总之，在医疗净化工程的设计和施工过程中，需要采取一系列措施来避免交叉感染，保证患者的安全和健康。同时，施工过程中需要遵守相应的标准和规范，确保医疗净化工程的质量和效果。